胃肠功能紊乱这种疾病和心理压力大、情绪不佳有很大关系，所以还可以采取心理治疗；合理饮食对于病情的缓解。也可以对症应用镇静剂、止痛药、维生素B6、腹泻或者便秘等药物治疗病情。
有的人因为工作的原因导致三餐不定时，饮食没有规律，时间长了可能会导致胃肠功能紊乱；还有的人因为压力太大，精神过于紧张，长时间处在烦恼、焦虑的状态中，也会影响到胃肠系统的正常运转，出现了胃肠功能紊乱，此时要注意及时调理。那么，胃肠功能紊乱如何治疗呢？
一、一般治疗
1、调整饮食
平时最好少吃产气的食物，比如牛奶，土豆，豆类等，以免导致肠胃功能紊乱症状更加严重。在炒菜的时候可以适当的加一些生姜，蒜，胡椒等调味品，这样能让排气大大的减少，可以缓解病情。
2、学会放松心情
当患者感觉到明显的疲乏时，暂时放下工作，给自己适当性的喘息机会，可以暂时排解工作上面临的压力，也可以适当性的走动一下，暂时避开低潮的工作气氛。
二、药物治疗
调节神经功能，改善睡眠。根据病情，可选用下述药物与方法。
1、镇静剂
可给予利眠宁、安定、氯丙嗪、苯巴比妥、眠尔通或谷维素等。
2、解痉止痛药
因为胃肠道功能紊乱导致腹痛症状出现时，可以应用阿托品、癫茄片等抗胆碱能的药物让平滑肌松弛，就能起到一定的解痉止痛的作用。
3、神经性呕吐
可用维生素B6。呕吐剧烈酌情给予冬眠灵、异丙嗪、吗叮啉等。
4、促进胃动力药
患有胃肠功能紊乱疾病时，患者常常会在进食后出现腹部饱胀、疼痛等不适感，如果适当的应用一些吗丁啉等促进胃动力的药物，促进胃肠蠕动，更好的消化和吸收食物，腹痛症状也能得到缓解。
